На земле Кемеровской области расположено несколько заповедников, а также национальный парк. Самый большой из заповедников –Кузнецкий Алатау. Он находится в центральной части горного массива, площадь его 412,9 тыс. га. Заповедник был создан в 1989 году. Его большая часть занята горными таежными лесами, типичными для этих мест. Самые распространенные деревья – пихты, ели, кедр. На восточных склонах растут лиственные леса. На альпийских лугах множество редких растений: радиола розовая, левзея, венерин – башмачок и др. Среди животных встречаются медведь, соболь, косуля, марал. Постоянный обитатель – дикий северный олень. Здесь гнездится 103 вида птиц. Некоторые из них в других местах встречаются очень редко – черный аист, беркут.

Не менее Кузнецкого Алатау широко известен Шорский национальный парк. Он расположен на юге Кемеровской области. Рельеф парка – сложная рассеченная реками и ручьями горная система. Некоторые вершины достигают 2 тыс. метров. Климат в этой местности резко континентальный. Снег держится с октября по апрель. В некоторых местах его глубина достигает до полуметра. Животный мир разнообразен: типичный для этих мест заяц-беляк, лисица, выдра, росомаха. Встречается горностай, ласка, бурый медведь, марал. Шорский Национальный парк – это просто соблазн для охотников. Здесь обитают серая утка, кряква обыкновенная, глухарь, рябчик, тетерев, коростель.

Достоянием Кемеровской области является и такой памятник природы как Кузедеевский липовый остров. Это участок площадью 100 кв. км., на котором растут реликтовые липы. Участок находится в небольшой котловине, благодаря чему температура в ней на несколько градусов выше. Его окружают горные хребты и древний родник не затронул эту территорию. Кузедеевский липовый остров – единственный в Сибири «остров» широколиственного леса посреди тайги.